在水之城新威尼斯上，乐天派的灯里和她的朋友们经历着各种各样的新鲜事，从这些与地球全然不同的际遇中，灯里渐渐地意识到要成为一名出色的领航员意味着什么。在机场，卡玛·派特（卡尔·潘 Kal Penn 饰）偶然遇到了他的前女友温妮莎，却惊讶地发现她就要结婚了。

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在快进争夺赛中失败的队伍必须回去执行普通任务。在一次行动中，蔡晓春因违犯军纪被开除军籍，赵百合和他一起离开了部队，后来听说他出国沦为雇佣兵。

更令探险队想不到的是，在他们之外来自外星的铁血战士也盯上了这里。他们只是存在着，却不是生活着。

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个性开朗活泼的卫藤可奈美（本渡枫 配音）、拥有着和年龄不相称的沉稳气质的十条姬和（大西沙织 配音）、温柔高贵的千金大小姐柳濑舞衣（和气杏未 配音）、沉默寡言内向不羁的糸见沙耶香（木野日菜 配音），在和荒魂战斗的同时，这些少女们还在争夺着专门为她们设置的竞技比赛的冠军宝座。危机任务3 摇滚巨星计划开一个前所未有的告别演唱会，场地定于一架珍宝747客机内空中进行，整个盛事亦会在一条互联网频道现场直播。